Trần Nữ Yên Khê sinh ra tại Đà Nẵng. Cô đã sống ở Paris từ khi một tuổi. Cô làm việc trong lĩnh vực điêu khắc, hội họa và điện ảnh. Cô học tại École Camondo danh tiếng, một trường thiết kế sản phẩm và kiến trúc nội thất ở Paris. “The artist Borderline” (2018), một tác phẩm điêu khắc nổi bật làm bằng sơn mài truyền thống Việt Nam, đã được Musée Guimet ở Paris mua lại vào năm 2019, làm nên lịch sử khi trở thành tác phẩm nghệ thuật đương đại đầu tiên từ Đông Nam Á được đưa vào Bộ sưu tập Quốc gia Pháp.
Bên cạnh việc thực hành nghệ thuật thị giác, Yên Khê đã xây dựng sự nghiệp điện ảnh nổi bật trong hơn 30 năm qua với tư cách là nữ diễn viên chính trong “Mùi đu đủ xanh” (1993), “Xích lô” (1995), và “Mùa hè chiều thẳng đứng” (2000), cùng nhiều phim khác. và gần đây là Giám đốc nghệ thuật và thiết kế trang phục cho “Muôn vị nhân gian” (2023), đạo diễn Trần Anh Hùng – người đoạt giải Đạo diễn xuất sắc nhất phim “Muôn vị nhân gian” tại Liên hoan phim Cannes lần thứ 76 và là phim đại diện cho Pháp tham dự Giải thưởng Oscar đồng thời lọt vào danh sách rút gọn 15 phim tranh Giải phim nước ngoài xuất sắc Oscar lần thứ 96.
Cuối năm 2023, Trần Nữ Yên Khê thực hiện triển lãm cá nhân về tranh và điêu khắc tại Galerie Quynh.
Cô nhận được đề cử César về trang phục cho phim “Muôn vị nhân gian”.